Theo kết luận của Thanh tra Sở GD-ĐT Hà Nội, nhiều nội dung tố cáo được xác định là sai như: Trường THPT Vân Tảo không có lớp chọn, nên không có việc lấy kết quả kiểm tra để cho HS vào lớp chọn; không có quy định thu học phí cả năm mà tùy theo điều kiện của từng gia đình; không ép HS mua cả hai loại bảo hiểm thân thể và bảo hiểm y tế; không có việc hiệu trưởng thu sai nguyên tắc và không công khai một số khoản tiền về dạy thêm; không có việc nhà trường áp dụng các hình thức kỷ luật hà khắc, thiếu tính sư phạm với HS; hiệu trưởng không xúi người đánh người đứng đơn.
Một số nội dung tố cáo được đoàn thanh tra xác minh là có thật, hiệu trưởng nhà trường phải chịu trách nhiệm như: tổ chức cho học sinh (HS) học Tin học khi nhà trường chưa đủ các điều kiện về cơ sở vật chất, đội ngũ; thu tiền học thêm cao gấp đôi quy định; thu và quản lý các khoản thu của các tổ chức xã hội, đoàn thể…Một số nội dung tố cáo khác chưa đủ căn cứ để kết luận như: việc giáo viên Đỗ Việt Khoa tố cáo hiệu trưởng bôi nhọ, nhục mạ cán bộ lãnh đạo; tố cáo khắp nơi trong tỉnh Hà Tây (cũ) có lạm thu và phụ huynh oán thán nạn lạm thu…
Chánh Thanh tra Sở GD-ĐT Lê Thiết Hùng cho biết tới đây, Phòng Tổ chức cán bộ (Sở GD-ĐT) sẽ đề xuất các biện pháp xử lý đối với những sai phạm của hiệu trưởng trường THPT Vân Tảo và những người có liên quan; phòng Kế hoạch - Tài chính sẽ có biện pháp xử lý đối với những khoản thu không đúng quy định của nhà trường. Đến ngày 31-12 đối tượng thanh tra và các đơn vị, cá nhân có liên quan phải báo cáo kết quả thực hiện cho Thanh tra Sở GD-ĐT Hà Nội.